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Thèmes de recherche
Thème de recherche n°2 Echinococcose-
Recherches actuelles
Développement d'outils de détection de biologie moléculaire
Recherche de nouveaux marqueurs radioactives dans le suivi de l'échinococcose alvéolaire par le TEP-scan
L'immunosuppression comme facteur agravant chez les patients EA
Parcours de recherche
Master Recherche (DEA) Environnement Santé Société (2003-2004) Intérêt de l'analyse microsatellite pour l'évaluation de la diversité génétique chez Echinococcus multilocularis.
Thèse - Ecole doctorale Homme Environnement Santé (2004-2008)Caractérisation et validation du marqueur microsatellite multilocus répété en tandem EmsB pour la recherche de polymorphisme génétique chez Echinococcus multilocularis : Application à l'étude de la transmission du parasite en Europe.
Post-doctorat (1) - Japon, Hokkaido (2008-2010)
Sujet 1 : Etudes phylogénétiques chez les espèces d'Echinococcus présentes en Europe à partir de l'analyse de 5 cibles nucléaires.
Sujet 2 : Etudes phylogénétiques chez Taenia en collaboration avec l'Institut des Sciences pour l'Ecologie et la Terre de Tartu, Estonie et l'Institut Haartman d'Helsinki, Finlande.
Sujet 3 : Développement de la technique de « Loop-mediated isothermal DNA amplification » (LAMP) pour la copro-détection d'Echinococcus spp. dans le foyer chinois.
Sujet 4 : Isolation et caractérisation de 3 marqueurs nucléaires chez Echinococcus et Taenia pour des études phylogénétiques Sujet 5 : Utilisation de tests sérologiques (ELISA) pour la confirmation d'infection àEchinococcus multilocularis chez des patients du Doubs (collaboration avec le CHU de Besançon).
Post-doctorat (2) - Besançon, Laboratoire de Physiopathologie anticancéreuse - Projet Interreg IsotopEchino (2011-2013)
Sujet 1 : Etude de nouveaux marqueurs pour la recherche d'activité des lésions d'échinococcose au PET-scanner
Sujet 2 : Protéomique et caractérisation des protéines présentes dans le contenu de vésicules d'Echinococcus multilocularis
Bibliographie
Ouvrages
2012 : Echinococcus and Echinococcosis, , Ito, A., Yanagida, T., Sako, Y., Nakao, M., Nakaya, K., Knapp, J., Ishikawa, Y. In : Molecular Detection of Human Parasitic Pathogen, (ed. by Liu D), CRC Press, p247-261
Articles
30 références ; 1er auteur = 9 articles ; 2ème auteur = 4 articles ; 3ème auteur = 8 articles.
1. C. Porot, J. Knapp, J. Wang, S. Germain, D. Camporese, Y. Seimbille, H. Boulahdour, D.A. Vuitton, B. Gottstein, O. Blagosklonov. Development of a Specific Tracer for Metabolic Imaging of Alveolar Echinococcosis : a Preclinical Study. Proc IEEE Eng Med Biol Soc , 2014 (in press).
2. S. Bresson-Hadnia, F. Grenouillet, A. Chauchet, C. Richou, J. Knapp, E. Delabrousse, S. Adrian-Félix, O. Blagosklonov, D.A. Vuitton, L. Millon. Diagnostic de l'échinococcose alvéolaire. Revue Francophone des Laboratoires - Juillet/Août 2014 - n°464, 69-79
3. J. Knapp, Y. Sako, F. Grenouillet, S. Bresson-Hadni, C. Richou, H. Gbaguidi-Haore, A. Ito, L. Millon. Serological comparisons between the rEm18-Immunochromatography test with ELISA rEm18 and Em2plus for the confirmation diagnosis of French Alveolar Echinococcosis patients. Accepté pour publication dans Parasite le 28/04/2014 (IF = 1.12) ; Q3
4. J. Knapp, L. Millon, L. Mouzon, G. Umhang, F. Raoul, Z. Said Ali, B. Combes, S. Comte, H. Gbaguidi-Haore, F. Grenouillet, P. Giraudoux. Real time PCR to detect the environmental faecal contamination by Echinococcus multilocularis from red fox stools. Veterinary Parasitology. 2014, 201(1-2):40-7. IF = 2.38 ; Q1
5. C. Cordon-Obras, J. Cano, J. Knapp, P. Nebreda, N. Ndong-Mabale, P. Ncogo-Ada, P. Ndongo-Asumu, J. Pinto, A. Benito, J.M. Bart. Phylogenetic analysis of Glossina palpalis palpalis, the vector of Trypanosoma brucei gambiense in Bioko island, Equatorial Guinea. C. Cordon-Obras, J. Cano Parasite & Vectors. 2014, 7:31. IF = 3.25 ; Q1
6. G. Umhang, J. Knapp, V. Hormaz, F. Raoul, F. Boué. Echinococcus multilocularis genetics traces back the history of expansion from an endemic area. Infectious Genetics and Evolution. 2014, 22:142-9. IF = 3.17 ; Q2
7. F. Grenouillet, A. Chauchet, C. Richou, D.A. Vuitton, J. Knapp, L. Millon, S. Bresson-Hadni. Échinococcose alvéolaire : épidémiologie, surveillance et prise en charge Alveolar echinococcosis : Epidemiology, survey and management. Journal des Anti-infectieux. 2013, 15 : 204-214.
8. Z. Said Ali, F. Grenouillet, J. Knapp, S. Bresson-Hadni, D. A. Vuitton, F Raoul, C. Richou, L. Million, P.Giraudoux and the FrancEchino Network. Detecting nested clusters of human alveolar echinococcosis. Parasitology. 2013 Nov ;140(13):1693-700. IF = 2.36 ; Q2
9. M. Piarroux, R. Piarroux, J. Knapp, K. Bardonnet, J. Dumortier, J. Watelet, A. Gerard, J. Beytout, A. Abergel, S. Bresson-Hadni, J. Gaudart ; FrancEchino Surveillance Network. Populations at risk for alveolar echinococcosis, France. Emerg Infect Dis. 2013 May ;19(5):721-8. IF = 5,99 ; Q1
10. H. L. Enemark, M. N. Al-Sabi, J. Knapp, M. Staahl, M. Chríel. Detection of a high-endemic focus of Echinococcus multilocularis in red foxes in southern Denmark, January 2013. Euro Surveill. 2013 ;18(10):pii=20420. IF = 5,49 ; Q1
11. J. Knapp, S. Staebler, J.M. Bart, A. Stien, N.G. Yoccoz, C. Drögemüller, B. Gottstein, P . Deplazes. Echinococcus multilocularis in Svalbard, Norway : microsatellite genotyping to investigate the origin of a highly focal contamination. Infection, Genetics and Evolution, 2012, 12(6):1270-4. IF = 2.78 ; Q2
12. A. Ito, M. Nakao, Y. Sako, T. Yanagida, K. Nakaya, J. Knapp, Y. Ishikawa. Echinococcus and Echinococcosis, 2012, in : Molecular Detection of Human Parasitic Pathogens (ed. by Liu D),CRC Press, 247-261.
13. J. Knapp, M. Nakao, T. Yanagida, M. Okamoto, U. Saarma, A. Lavikainen, A. Ito. Phylogenetic relationships within Echinococcus and Taenia tapeworms (Cestoda : Taeniidae) : an inference from nuclear protein-coding genes. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2011, 61(3):628-38. IF = 4.06 ; Q1
14. D.A. Vuitton, Q. Wang, H.X. Zhou, F. Raoul, J. Knapp, S. Bresson-Hadni, H. Wen, P. Giraudoux. A historical view of alveolar echinococcosis, 160 years after the discovery of the first case in humans : part 1. What have we learnt on the distribution of the disease and on its parasitic agent ? Chin Med J, 2011, 124(18):2943-53. IF = 0.91 ; Q3
15. M. Piarroux, R. Piarroux, R. Giorgi, J. Knapp, K. Bardonnet, B. Sudre, J. Watelet, J. Dumortier, A. Gérard, J. Beytout, A. Abergel, G. Mantion, D.A. Vuitton, S. Bresson-Hadni. Clinical features of Alveolar Echinococcosis in France from 1982 to 2007 : results of a survey in 387 patients. Journal of Hepatology, 2011, 17(7) : 1161-8. IF = 9,86 ; Q1
16. S. Bresson-Hadni, O. Blagosklonov, J. Knapp, F. Grenouillet, Y. Sako, E. Delabrousse, M.-P. Brientini, C. Richou, A. Minello, A.T. Antonino, M. Gillet, A. Ito, G. Mantion, D.A. Vuitton. Should possible recurrence forbid liver transplantation in patients with end-stage alveolar echinococcosis ? A 20-yr follow-up. Liver Transplantation, 2011, 17(7) : 855-65. IF = 3.94 ; Q1
17. F. Grenouillet, J. Knapp, L. Millon, V. Raton, C. Richou, M. Piarroux, R. Piarroux, G. Mantion, D.A. Vuitton, S. Bresson-Hadni. L'Echinococcose alvéolaire humaine en France en 2010. Bulletin Epidemiologique Hebdomadaire. 2010, Hors-série, e : 24.
18. A. Nkouawa, Y. Sako, S. Itoh, A. Kouojip-Mabou, C. N. Nganou, Y. Saijo, J. Knapp, H. Yamasaki, M. Nakao, K. Nakaya, R. Moyou-Somo, A. Ito. Serological studies of neurologic helminthic infections in rural areas of southwest Cameroon : toxocariasis, cysticercosis and paragonimiasis. PLoS Neglected and Tropical Diseases. 2010, 4(7) : e732. IF = 4.57 ; Q1
19. M. Nakao, T. Yanagida, M. Okamoto, J. Knapp, A. Nkouawa, Y. Sako, A. Ito. State-of-the-art Echinococcus and Taenia : phylogenetic taxonomy of human-pathogenic tapeworms and its application to molecular diagnosis. Infection, Genetics and Evolution. 2010, 10 : 444-452. IF = 2.78 ; Q2
20. J. Knapp, J.M. Bart, S. Maillard, B. Gottstein, R. Piarroux. The genomic Echinococcus microsatellite EmsB sequences : from a molecular marker to the epidemiological tool. Parasitology. 2009, 22:1-11. IF = 2.36 ; Q2
21. J. Knapp, M. Chirica, C. Simonnet, F. Grenouillet, J.M. Bart, Y. Sako, S. Itoh, M. Nakao, A. Ito, L. Millon Echinococcus vogeli Infection in a Hunter, French Guiana. Emerging Infectious Disease. 2009, 15(12). IF = 5.99 ; Q1
22. S. Maillard, B. Gottstein, K. Haag, I. Colovic, M.C. Benchikh-Elfegoun, S. Ma, J. Knapp, R. Piarroux. The tandemly repeated multilocus microsatellite EmsB : a new tool to investigate the genetic diversity of Echinococcus granulosus sensu lato. Journal of Clinical Microbiology. 2009, 47(11) : 3608-16. IF = 4.07 ; Q1
23. J. Knapp, J.M. Bart, P. Giraudoux, M.L. Glowatzki, I. Breyer, F. Raoul, P. Deplazes, G. Duscher, K. Martinek, P. Dubinsky, M.H. Guislain, F. Cliquet, T. Romig, A. Malczewski, B. Gottstein, R. Piarroux. Genetic Diversity of the Cestode Echinococcus multilocularis in Red Foxes at a Continental Scale in Europe. PLoS Neglected and Tropical Diseases. 2009, 3(6) : e452. IF = 4.57 ; Q1
24. A. Casulli, J.M. Bart, J. Knapp, G. La Rosa, G. Dusher, B. Gottstein, A. Di Cerbo, M.T. Manfredi, C. Genchi, R. Piarroux, E.Pozio. Multi-locus microsatellite analysis supports the hypothesis of an autochtonous focus of Echinococcus multilocularis in northern Italy. International Journal for Parasitology. 2009, 39 : 837-842. IF = 3.64 ; Q1
25. J. Knapp, M.H. Guislain, J.M. Bart, F. Raoul, B. Gottstein, P. Giraudoux, R. Piarroux. Genetic diversity of Echinococcus multilocularis on a local scale. Infection, Genetics and Evolution. 2008, 8 (3) : 367-373. IF = 2.78 ; Q2
26. J. Knapp, J.M. Bart, M.L. Glowatzki, A. Ito, S. Gerard, S. Maillard, R. Piarroux, B. Gottstein. Assessment of use of microsatellite polymorphism analysis for improving the spatial distribution tracking of Echinococcus multilocularis. Journal of Clinical Microbiology. 2007, 45 (9) : 2943-50. IF = 4.07 ; Q1
27. S. Maillard, M.C. Benchikh-Elfegoun, J. Knapp, J.M. Bart, P. Koskei, B. Gottstein, R. Piarroux. Taxonomic position and geographical distribution of the common sheep G1 and camel G6 strains of Echinococcus granulosus in three African countries. Parasitology Research. 2007, 100 : 495-503. IF = 2.85 ; Q2
28. M. Piarroux, S. Bresson-Hadni, I. Capek, J. Knapp, J. Watelet, J. Dumortier, A. Abergel, A. Minello, A. Gérard, J. Beytout, R. Piarroux, B. Kantelip, E. Delabrousse, V. Vaillant, D. Vuitton, pour le réseau FrancEchino, 2006. Surveillance de l'échinococcose alvéolaire en France : bilan de cinq années d'enregistrement 2001-2005. Bulletin Epidémiologique Hebdomadaire. 2006, n°27-28/2006 : 206-208.
29. J.M. Bart, J. Knapp, B. Gottstein, F. El-Garch, P. Giraudoux, M.L. Glowatzki, H. Bethoud, S. Maillard, R. Piarroux, 2006. EmsB, a tandem repeated multi-loci microsatellite, new tool to investigate the genetic diversity of Echinococcus multilocularis. Infection, Genetic and Evolution. 2006, 6 : 395-400. IF = 2.78 ; Q2
30. J.M. Bart, S. Morariu, J. Knapp, M.S. Ilie, M. Pitulescu, A. Anghel, I. Cosoroaba, R. Piarroux. Genetic typing of Echinococcus granulosus in Romania. Parasitology Research. 2006, 98 : 130-7. IF = 2.85 ; Q2